我校呈贡校区二期工程建设项目于2013年11月14日获《云南省发展和改革委员会关于云南中医学院呈贡校区二期工程建设项目可行性研究报告的批复》（云发改社会[2013]1850号）批准建设，可研批复总建筑面积11.97万㎡，总投资4.85亿元。2015年5月，项目获得昆明市规划局签发的规划许可证副本。2015年6月，项目获《云南省住房和城乡建设厅、云南省发展和改革委员会关于云南中医学院呈贡校区二期工程建设项目初步设计的批复》（云建设[2015]284号）文件的初设批复，批复总建筑面积12.54万㎡，建设总投资为5.23亿元。

该项目建筑单体包括学生公寓、食堂综合楼、体育综合楼、系办公楼、实验楼群、教学楼群、中水处理站和室外附属工程。项目于2016年9月1日陆续开工建设，计划2017年年底前投入使用。